Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc71lE9Q4T4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc71lE9Q4T4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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