Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4E0

5031410I06Rik, RIKEN cDNA 5031410I06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
5031410I06RikE9Q4E0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
5031410I06RikE9Q4E0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms