Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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