Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Susd1E9Q3H4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms