Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Aldh3b2E9Q3E1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms