Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tarbp1E9Q368 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tarbp1E9Q368 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms