Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3893E9Q1I1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3893E9Q1I1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3893E9Q1I1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms