Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gm3095E9Q058 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3095E9Q058 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms