Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scaf11E9PZM7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms