Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chd2E9PZM4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Chd2E9PZM4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms