Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gcom1E9PZ54 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gcom1E9PZ54 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms