Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Srp54bE9PXC0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp54bE9PXC0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms