Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl3lE9PWZ3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl3lE9PWZ3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms