Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
4931408C20RikE9PWP9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931408C20RikE9PWP9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms