Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim30dE9PWL0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms