Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930444G20RikD3Z741 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930444G20RikD3Z741 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930444G20RikD3Z741 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930444G20RikD3Z741 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930444G20RikD3Z741 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930444G20RikD3Z741 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930444G20RikD3Z741 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930444G20RikD3Z741 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930444G20RikD3Z741 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
4930444G20RikD3Z741 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4930444G20RikD3Z741 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4930444G20RikD3Z741 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms