Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp6ap1lD3Z5W0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms