Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hfm1D3Z4R1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hfm1D3Z4R1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Hfm1D3Z4R1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hfm1D3Z4R1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hfm1D3Z4R1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Hfm1D3Z4R1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms