Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm1330D3Z460 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms