Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms