Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm4871D3Z0W7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm4871D3Z0W7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms