Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem200bD3Z0P8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms