Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc6D3YZP9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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