Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kif28pD3YXS5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms