Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd1D3YXK1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd1D3YXK1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd1D3YXK1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd1D3YXK1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd1D3YXK1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms