Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rexo5D3YW29 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms