Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3259D3YUK0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm3259D3YUK0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms