Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm17333C6EQI3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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