Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfap1bC0HKD9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms