Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprz1B9EKR1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptprz1B9EKR1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms