Protein–RNA interactions for Protein: B9EJQ9

Rhox3g, Reproductive homeobox 3G, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3gB9EJQ9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox3gB9EJQ9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3gB9EJQ9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms