Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hbb-bh2B2RVB7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms