Protein–RNA interactions for Protein: B2RV46

Spata6l, Spermatogenesis associated 6-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata6lB2RV46 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spata6lB2RV46 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spata6lB2RV46 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms