Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usf3B2RUQ2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms