Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AU015836B2RUM3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms