Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prrt4B2RU40 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrt4B2RU40 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms