Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brpf3B2KF05 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brpf3B2KF05 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms