Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm436B1AVU6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm436B1AVU6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms