Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PtpruB1AUH1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PtpruB1AUH1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PtpruB1AUH1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms