Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trabd2bB1ATG9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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