Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp36B1AQJ2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms