Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms