Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc9bA3KGF9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms