Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf39A2RT81 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf39A2RT81 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms