Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Samt1A2BED8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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