Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AI481877A2ALV5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AI481877A2ALV5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AI481877A2ALV5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AI481877A2ALV5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AI481877A2ALV5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AI481877A2ALV5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AI481877A2ALV5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
AI481877A2ALV5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AI481877A2ALV5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AI481877A2ALV5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AI481877A2ALV5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AI481877A2ALV5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms