Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Itgb4A2A863 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb4A2A863 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb4A2A863 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms