Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l1A2A259 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l1A2A259 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms