Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms