Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc173A0JLY1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc173A0JLY1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms